Aby zapewnić możliwie jak najlepszą elastyczność tworzenia muzyki, DJM-3000 wyposażono w pierwszy w branży tryb EFFECT MIX, który dokładnie oddziałuje na układ frazy w operacji BMP-linked w połączeniu z poprawionym efektorem auto beat. Dodatkowo do funkcji ECHO i ZIP, Pioneer przedstawił nowy w branży efekt o nazwie "Roll". Odtwarza on mix w czasie zmiany pitch utworu przez chromatyczną skalę do beatu muzyki. To nowa funkcja umożliwiająca DJ-om podniesienie poziomu ich grania, na nowy nie znany dotąd poziom.
Mając wciąż najdokładniejszy wewnętrzny licznik uderzeń na minutę, licznik AUTO BMP automatycznie mierzy i podaje BMP odtwarzanego utworu ( zakres miary: 70-139 / 91-180 / 70-180 / Ręczne ) umożliwiając użytkownikowi gładkie przejście z jednego utworu w drugi. Tapping w przyciski TAP, umożliwia ręczne wprowadzenie BMP utworów które są trudne do zmierzenia. DJ-eje mogą teraz zobaczyć beat muzyki, przez co łatwiej i szybciej mogą miksować utwory z różnym beatem.

Tak jak w DJM-600, DJM-3000 przejął od swojego mniejszego brata wszystkie jego efekty Delay, Echo, Auto Pan, Flanger, Pitch Shifter reverb, Auto-Transform i Auto Frequency Filter, przy czym wszystkie funkcje są auto BMP effectable. Połączone z BMP, DJM-3000 może dodać efekty do każdego wejścia (CHANNEL, MIC I MASTER) osobno. Użytkownik może tworzyć muzykę, która robi pełny użytek z wysokiego poziomu technik DJ, przez przedstawienie szybkich ustawień z BEAT UNIT SWITCH BUTTON, dostrajaniem precyzyjnych parametrów czasowych lub kontroli balance-u pomiędzy efektami dźwiękowymi i oryginalną ścieżką dźwiękową przez odróżnianie mix ratio. Ponadto nawet używając fadera, możliwe jest pozostawienie tylko efektów dźwiękowych bez łączenia BMP. W połączeniu z produktami serii CDJ lub CMX, DJM-3000 może rozpocząć odtwarzanie utworu przy użyciu sliding cross fadera lub fadera kanałowego. Może zmiksować ścieżki bez kreowania przestrzeni przez ustawienie punktu stand-by track's cue i użycie single-action cut-in. Odkąd sam powraca do punktu cue przez back fader, odtwarzanie sampler-style jest również możliwe. Cross fader ma również wybieralny fader curve aby dopasować wszystkie style DJ-owania.
Dla najbardziej wymagających istnieje możliwość zakupu opcjonalnych obrotowych gałek regulacji głośności w celu płynniejszego miksowania.